Molecular Operating Environment (MOE) v2022.02激活版下载(附安装教程)

Chemical Computing Group MOE (Molecular Operating Environment) 2022破解版是一款基于窗口的交互式化学计算和分子建模工具,是领先的分子操作环境解决方案,领先的药物软件,使用提供完整的可视化、建模、模拟、方法开发等诸多功能优势,先进的技术,完美符合标准规范,基于结构的设计、发现和研究分析,是适合生物学家、药物学家、化学家等可使用的创新工具。

2022新版本带来基于浏览器的动态组合库枚举,scFv 和定制抗体同源模型,GPU 加速的蛋白质建模和蛋白质-蛋白质对接,用于加速 MD 和 TI 的氢质量再分配,数据库查看器 SNFG 显示、图形对象和增强的绘图等诸多新功能、增强功能和改进,欢迎需要此款工具的朋友前来下载使用。

Chemical Computing Group MOE v2022.02 激活版下载(附安装教程)-1

功能特色

CCG 是为制药和生物技术公司以及全球学术机构提供分子建模、模拟和机器学习软件的领先开发商和供应商。 CCG 与其数学家、科学家和软件工程师团队并通过与客户的科学合作不断开发新技术。

发现平台

-化学家的公共平台

-生物学家和晶体学家

-小分子 – 肽 – 生物制品

-笔记本电脑 – 集群 – 云 – 管道

-集成编程环境

协作支持

– 专家级科学支持

-科学项目合作

-现场和远程培训

-UGM、研讨会和网络研讨会

-美洲、欧洲和亚洲办事处

行业领导力

-25 年以上的创新

-制药和生物技术标准平台

– 广泛的文献和专利引用

– 全球用户社区

-大规模部署

3D 分子可视化

– 易于使用的图形界面

-主动站点检测和分析

-分子表面和电子密度

-可视化非键相互作用

-出版质量图像和电影

-GPU 加速 3D 立体图形

-混合虚拟现实和 3D 打印

基于结构的设计

– 简化的配体设计界面

-主动站点检测和分析

– 口袋中的交互式配体设计

-蛋白质-配体相互作用图

-预测水位和能量学

-Induced-Fit 对接

-链接、增长和替换片段

抗体和生物制剂设计

-基于结构的蛋白质工程

-评估负债和可开发性

-优化亲和力、稳定性和溶解度

-高通量抗体建模

– 生成虚拟图书馆

-蛋白质对接和表位作图

-模型 ADC 和融合蛋白

系统要求

操作系统:Windows 8/10/11

安装激活教程

1、在本站下载并解压,如图所示

Chemical Computing Group MOE v2022.02 激活版下载(附安装教程)-2

2、安装程序,勾选我接受许可证协议条款

Chemical Computing Group MOE v2022.02 激活版下载(附安装教程)-3

3、安装目录

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4、选择license.dat

Chemical Computing Group MOE v2022.02 激活版下载(附安装教程)-5

5、安装完成,不要启动,将破解的moe.exe、moebatch.exe复制到安装目录中,替换(C:\Program Files\moe2022\bin-win64)

Chemical Computing Group MOE v2022.02 激活版下载(附安装教程)-6

6、检查 license.dat 是否在这个路径上:C:\Program Files\moe2022 如果不是,从破解文件夹复制粘贴它!!

新功能

1、新的! GPU 信息。 教育部 | 帮助 | GPU 信息打开新的 GPU 信息面板,报告将使用哪个 GPU 设备(默认设备)进行 GPU 计算。显示 GPU 驱动程序和计算能力版本,以及内存、时钟速度、多处理器数量、CUDA 内核数量和 GPU UUID。还指出了与 MOE GPU 加速应用程序的兼容性。

2、碳水化合物检测和描述。添加了对碳水化合物检测和显示的支持。

聚糖 ( SNFG ) 表示的符号命名法。 可以使用 SNFG 符号描述检测到的碳水化合物。

更新了 carbo.mdb。 $MOE/lib/carbo.mdb 已更新以涵盖 SNFG 命名法中的所有碳水化合物。

碳水化合物生成器。碳水化合物生成器(MOE | 编辑 | 构建 | 碳水化合物)已更新如下:

已添加 SNFG 符号显示。

碳水化合物生成器现在可连接/可拆卸。

3、数据库查看器显示。数据库查看器具有新的分子显示功能,还支持图形对象的显示。

显示 | 分子 菜单面板。显示器| 分子菜单已替换为可以设置分子、氢和标签显示模式的面板。

碳水化合物分子展示。添加了碳水化合物显示模式,其中碳水化合物会自动检测并使用 SNFG 符号显示。

仅序列分子显示。添加了仅序列显示模式,其中蛋白质和核酸以 FASTA 格式显示为序列数据。

极地氢显示。仅显示极性氢的选项。

手性显示。可选择显示带有键楔和手性标签的原子立体化学;仅在以 2D 显示分子时适用。

分子名称。现在默认启用分子名称的显示。

每个字段的统一视图。现在从DBV |启用统一视图模式。分子字段弹出 菜单,仅适用于当前字段;该选项仅在 3D 显示模式下可用。

显示图像和图形对象。包含编码为字符串的 PNG 图像或 MOE 图形对象 (grob) 数据的字符字段将自动显示 grob/png 图像。

缩放和翻译。2D、碳水化合物、grob 和 PNG 图像可以使用 Ctrl+Middle-drag 进行缩放,并使用 Middle-drag 进行平移。

4、数据库查看器查找。DBV 搜索功能增强如下:

单个查询中的多个搜索条件。现在可以在同一查询行中指定多个数字和文本搜索(例如>10 <30 );这在搜索所有字段、数字字段或文本字段时很有用。

用于组合搜索条件的 And 和 Or 模式。当单个搜索行中存在多个条件时,And 要求满足所有条件才能成功匹配,而Or只需要满足一个条件。

搜索数值向量。对于包含数值向量的数据库单元格,只要在 And 或 Or 模式下匹配单元格中的一个值,就可以成功搜索。

通配符文本搜索现在是可选的。在文本字段搜索中使用通配符现在是可选的。匹配选项已更新为:

部分。启用后,将执行精确的子字符串匹配。

通配符。启用后,将使用findmatch语法解释搜索文本以执行搜索。禁用时,特殊字符(例如 * 或 [ )不会被视为通配符。

案例。启用后,搜索区分大小写。

5、数据库查看器图。数据库查看器图现在是一个 SVL 面板,并具有以下新功能。

指定绘图类型。绘图类型——数据图(对应于以前的默认绘图类型)、 相关图、场直方图——现在在使用 DBV |打开绘图时指定。页脚 | 情节。

附加/分离功能。DBV 图现在可以分离和重新连接。

多个地块。由于可以分离 DBV 图,因此现在支持多个图。

缩放和翻译。滚轮可用于缩放绘图显示,中键可用于在 X 和 Y 方向移动显示。

取消选择。Ctrl-单击将取消选择一个绘图点。Shift-drag 扫出一个与当前选择进行“与”运算的选择矩形;即,所得到的选择将是已经选择的点并且落在Shift-selection 区域中。

6、绘制选定的字段。DBV中的新选项 | Plot Popup重置绘图以显示数据库查看器中当前选定字段中的数据。

对数刻度。在剧情中 | 弹出 | 设置面板,比例 | 对数是在数据轴上打开对数缩放的新选项;即数据图中的 Y 轴,以及相关图中的 X 轴和 Y 轴。

bubbleHelp 中的配体描述。除了显示在图中的字段值之外,绘图点上的气泡帮助现在还显示配体描述。

双击滚动到条目。双击一个绘图点将滚动条目显示以显示相应的条目。

7、 数据库查看器打印。Database Viewer 打印工具提供以下更新:

支持混合 PNG、图形对象、碳水化合物、2D 和 3D 显示。双击包含图像或图形对象的单元格将打开“导出图像”面板。

滚动条添加到打印预览。

摩尔风格。使用(SNFG)表示显示碳水化合物的新选项;非碳水化合物将以 2D 模式显示。

使用现有的 2D 坐标。新选项;仅当数据库单元包含预先计算的 2D 坐标时才启用。

显示手性。启用时使用键楔和手性标签显示原子立体化学的新选项;仅在以 2D 显示分子时适用。

显示所有氢。在显示的原子上显示所有氢的新选项。

不要给杂原子着色。重铸以前的“彩色热原子”。默认情况下禁用该选项。

8、数据库查看器分子名称。数据库分子命名选项已添加如下:

自动命名选项。数据库分子名称现在可以自动设置为链名称、 链标签或自动 (使用第一个非空链标签,否则使用链名称)。

在数据库中创建分子时设置数据库分子名称的选项已添加到新数据库、添加条目和从 MOE 面板复制分子。

分子名称。DBV | 计算 | 分子 | 分子名称 面板已更新如下:

从分子中提取有一个新的链标签选项。

Store In Molecule更新了新的 Tag和Name选项,一个用于指定 Concatenate to existing name选项的名称后缀的文本字段,以及一个新的Use Field Precision选项,用于在从数值字段。

9、数据库查看器着色。数据库查看器字段着色面板已增强如下:

流线型布局。面板设计经过简化,易于使用。

DBV 菜单面板。字段着色面板现在直接在菜单中打开,但可以作为独立面板分离。

多箱范围规范。新的 bin 着色模式具有可配置数量的 bin,由范围的两个端点和每个 bin 的中点值指定。值落在给定 bin 中的数据库单元格由 bin 颜色着色;即没有梯度。值超出 bin 范围的单元格不着色。

渐变和对数渐变着色。以前的范围/斜坡功能已更新为使用可配置数量的 bin,类似于多 bin 范围规范。每个 bin 在 bin 中点分配一个颜色,并且对范围内的颜色进行插值。范围之外的值被分配端点的颜色。

自动范围设置。通过按下刷新按钮,可以从当前数据库字段值中自动检测范围和梯度规范的端点。

撤消。用于撤消上一次着色操作的新按钮。

自定义. 用于以自定义名称保存当前颜色规则或加载已保存规则的新按钮。

非空单元格的颜色规则。 非空已添加到单元格着色选项中,以将着色规范应用于非空单元格。

控制 DBV 文本着色的新选项已添加到“配置选项”面板的“数据库查看器”页面。 在深色背景上反转文本颜色,启用后,当单元格具有深色背景颜色时,反转文本/前景色。当字段着色使单元格背景变暗时,这可能会使文本更具可读性。

10、数据库浏览器。数据库浏览器已更新如下:

碳水化合物显示已添加为新的 2D 模式。

Dock 浏览器中添加了 新的Pocket选项:

袖珍视图。启用选项启用/禁用口袋视图。禁用时,浏览的受体结构被隐藏并变为惰性。

受体碳着色。一个复选框现在启用/禁用受体的碳原子着色。默认颜色为深绿色。

配体渲染样式。新的配体渲染选项允许为配体着色(默认为亮绿色)并更改原子/键显示模式。复选框启用/禁用配体原子渲染。仍然可以使用MOE |更改配体渲染。页脚渲染控件。

浏览结构的单独标签。被浏览的结构现在被分配了他们自己的标签,这是以“浏览器”为后缀的原始标签。当一个结构被保留(Keep | Receptor或Ligand)时,标签恢复到原来的状态。

浏览原子集。 已浏览的结构现在已添加到“浏览器原子”集中

RC 变量。RC 变量dbbrowse.tag.suffix 和dbbrowse.tag.suffix.dbbrowse_Dock控制用于浏览结构标记的后缀。

11、数据库计算器。已添加选项Use 0 for Empty Cells以将空单元格视为 0 进行逐行操作。

12、数据库菜单。用于编辑和选择的数据库查看器菜单已更新如下:

菜单 菜单项 描述

DBV | 编辑 选择字段 用于打开“选择字段”提示器的新菜单项。

DBV | 字段弹出 选择字段 更新。现在可以在同一行中指定多个字段名称;使用单引号将包含空格的字段名称括起来。一个新的应用按钮,或等效的 Shift-Return,在保持提示打开的同时执行搜索。

DBV | 字段弹出 | 选择条目 数字

不是数字 字符字段的新选项选择包含或不包含表示数值的文本的条目。

DBV | 字段弹出 | 选择条目 第一次出现 重命名菜单项“唯一”。

DBV | 字段弹出 清除所选 新选项可在确认后删除当前字段中选定条目的单元格内容。

DBV | 字段弹出 编辑所选 新的菜单选项,用于为当前字段中选定条目的单元格打开编辑提示器。

DBV | 分子字段弹出窗口 转换为序列 为“moe”和“分子”字段添加了新选项,通过删除所有原子信息将分子转换为仅序列。

DBV | 编辑 新条目 当系统中有选中的原子时, Add Entry 面板中的Selection 将自动设置为 Selected Atoms(否则将设置为Ignore)。

13、情节。

相关图。新的回归线模式已添加到数据库查看器相关图中。

Quadratic、Logarithmic、Exponential和 Power回归线现在可用。

新的自动选项选择最适合数据的回归线类型。

相关图现在支持绘制第三个和第四个数据字段,第三个数据字段使用颜色范围显示,第四个数据字段使用数据点大小显示。

二面等值线图。 二面等值线图已更新。请注意,它在菜单中的位置已更改为 MOE | 计算 | 构象 | 二面等值线图。

当前角度标记。一组十字准线现在显示在图中,指示当前的二面角值。

从绘图设置二面角。在绘图中单击将在 MOE 中设置分子中的二面角。

预设二面角。在启动应用程序之前,可以通过在 MOE 系统中选择两个键来预先指定二面角。

3D 窗口中的二面角计。在 MOE 3D 绘图区域中的分子上显示二面角计,以显示正在探索的二面角。

二面角。新按钮允许重新定义二面角并更新绘图。

更新。用于重新计算绘图的新按钮。

出口。用于打开“导出”面板的新按钮。

14、图形对象导出。通过Print | 导出图形对象 导出页面已通过以下功能得到增强:

复制到剪贴板。

剪贴板 PNG已添加格式选项。剪贴板内容可以粘贴到数据库查看器字符字段单元格中,其中将自动显示 grob。使用 MOE 放置在剪贴板上的 PNG 图像 | 页脚 | | 复制图片也可以粘贴到数据库查看器中。

剪贴板 GROB已添加到格式选项中,当按下 OK 时,会将编码为字符串的 grob 放到剪贴板上。剪贴板内容可以粘贴到数据库查看器字符字段单元格中,其中将自动显示 grob。

背景透明度。透明背景用方格背景表示。新的背景 选项在启用时允许指定不透明的彩色背景(默认为白色)。

每个 grob 设置。如果有多个 grobs,可以单独配置设置。

15、文件格式。 添加了对以下文件格式的支持:

SDF V3000 增强立体化学。添加了对 V3000 的支持,该支持允许指定部分和混合立体化学以及立体基团。立体化学基团类型有:

V3000 立体化学

绝对(ABS)。绝对构型是已知的。

相对 (OR)。一组立体中心之间的相对配置是已知的,但绝对配置是未知的。因此,该结构代表单一立体异构体。

外消旋(AND)。立体异构体的混合物:一对对映异构体或所有非对映异构体的集合。

V3000 立体声编码支持如下:

增强的 SMILES 立体声注释对 V3000 立体声进行编码。V3000 立体声音集具有编号 ID,由“@”后跟数字表示,特殊情况下“@”和“@@”分别用于第 1 和第 2 组。

MOE mdb 分子格式已得到增强,可对 V3000 立体声进行编码。

用于大型 PDB 文件的 Hybrid-36 格式。现在支持用于扩展残基 UID 和原子序列号超出默认 PDB 格式所施加的 5 位限制的 base 36 系统。该系统向后兼容标准 PDB 编号。

RCSB 搜索 API v2。MOE 已迁移到使用 2022 年 4 月 13 日发布的 RCSB PDB 搜索 API 的第 2 版。

教育部项目中的 mmCIF。MOE 项目数据库现在直接支持使用 mmCIF 文件。RCSB mmCIF 发行版现在是项目数据库和项目数据库更新应用程序的主要数据源,如果 CIF 文件不可用,则可以回退到 PDB 文件。

PDB 琥珀色 22。AMBER22 选项已添加到 文件 | 保存 | 蛋白质数据库在写出 PDB 文件时使用新的 AMBER ACE/NME 原子命名方案。

PRMTOP OBC。 文件 | 保存 | AMBER 拓扑文件现在将 OBC (igb5) 隐式溶剂参数写入 AMBER PRMTOP 文件。

16、应用中的电子密度。DSN6 地图和 CIF 结构因子支持已添加到 Energy Minimize 和 Dock。

17、二维叠加。教育部| 页脚 | 2D 叠加已更新如下:

标签名称已添加到显示中。

现在显示了附着点和 R 组。

到达最后一个或第一个结构时,下一个和上一个按钮将换行。

18、质子3d . 添加了对 U(尿嘧啶)的支持。

19、扭转剖面。添加了一个新的计算费用选项。

20、小部件。 对组成面板的小部件进行了以下更新。

范围滑块。这个新的小部件提供了一个双拇指滑块,表示具有开始和停止值的值范围。

在拇指之间单击拖动将导致两个拇指被拖动,从而保持它们之间的相对分离。

鼠标滚轮或左键单击范围区域的左侧或右侧将两个拇指移动一个滑块单位。

中键单击移动两个拇指,尝试将单击点定位在范围的中间。

使用 Ctrl 键修改鼠标单击会自行移动最近的拇指。

“滑块值”。启用后,在缩略图附近显示与缩略图关联的值。将鼠标悬停在值上时,左键单击将打开一个文本字段,在其中明确设置值。

Z 剪辑 ( MOE | Footer | ZClip ) 现在使用范围滑块进行分子和表面剪辑。

滑块。

‘滚动条’。sliderStyle的这个新值 以滚动条的样式显示滑块。

“滑块值”。启用后,在拇指附近显示与拇指关联的值。将鼠标悬停在值上时,左键单击将打开一个文本字段,在其中明确设置值。

绘图小部件。SVL 绘图小部件已更新:

线条和标记样式。添加了新的线条(solid-light、 ‘dashed-light’、’dotted-light’)和标记(’round-dot’、’fine-cross’)样式。

3D 和 4D 散点图。散点图现在可以显示 3 维或 4 维序列数据。3d 维度使用色带来限定绘图点,第 4 维度使用大小。在 Plot Attributes 弹出面板中,Z 轴表示第 3 维(如果使用),W 轴表示第 4 维(如果使用)。和

对数显示。轴选项卡上的绘图属性面板/弹出窗口中添加了对数显示模式选项。

21、PSILO 查询。教育部PSILO页面| 文件 | 已更新开放面板以包含数据库作为标识符,与新的 PSILO 联合数据库框架兼容。查询的结果是数据库内容的列表。

22、第三方软件。 MOE 2022.02 支持:

高斯 g16 c.01

MOPAC2016

NAMD 2.14

 

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