CLC Genomics Workbench 24.0.1免费下载
产品介绍
CLC Genomics Workbench是第一个综合分析系统，它能快速分析和显示新一代测序平台数据包括Illumina的Solexa, Roche 454的GS, ABI的SOLiD, Helicos的HeliScope。通过使用该平台,科学家可以轻松地使用自主研发的算法来支持和扩展工作流程，其界面友好而直观，操作简便，易于掌握。
产品功能
End-to-end的NGS数据分析
CLC Genomics Workbench是一个强大的软件，由专业人士开发的为相关人员进行分析和可视化下一代测序(NGS)数据。它的尖端技术融合了独特的特性和算法，被业界和学术界的科学领袖广泛使用，以克服与数据分析相关的瓶颈挑战。
SNP检测
CLC Genomics Workbench提供基于NQS（Neighborhood Quality Standard）算法的自动化SNP检测。如果参考序列带有ORF或者CDS注释，SNP检测也将报告该SNP是同义突变还是非同义突变。如果SNP导致翻译产生的蛋白质中的氨基酸发生改变，那么新的氨基酸将被报告。而它的图形用户界面能让用户轻松识别SNP，在或大或小的基因组区段都能获得SNP的全貌图。
多样本分析
在进行不同样品的批量测序时，通过使用多样本分析技术可以在同一流程中运行多个样本。通常情况下，不同样品的reads很难分离。因此，来自同一样本的reads被放在一起分析。
CLC Genomics Workbench支持大量多样本方案，包括基于名称的多种类型的多样本方案及基于标签或条码的多样本方案。
小RNA分析
CLC Genomics Workbench可对SOLiD、Illumina和454系统产生的小RNA序列进行分析。分析的第一步是接头的去除及从多样本数据中提取某一样本的数据，然后进行标签计数，最后利用miRBase 及其他数据资源对小RNAs进行注释。在前体或成熟的miRNA水平上可进行分组注释。最终的结果可利用表达分析工具来查看和分析。
表观基因组学分析
CLC Genomics Workbench含有全套整合的ChIP测序分析方案，用户可轻松将数据比对到参考序列，而得到ChlP测序结果的高级视图和图表输出。数据可以是基于ChlP的单个样本信息，也可以是ChlP样本和对照样本的比较信息。
定制化服务
CLC bio为CLC Genomics Workbench和CLC Genomics Server提供一个免费的基于Java的软件开发工具包（SDK）。用户使用这个软件开发工具包，可以将自有算法整合到我们的产品中。此外，我们还能根据客户的特定需求，为CLC Genomics Workbench和CLC Genomics Server设计和开发定制化的附加模块。这无疑成为客户提高研究速度和研究质量的一种快速而经济的方法。
产品特色
Read mapping
CLC Genomics Workbench的序列比对功能支持short reads、long reads及paired reads；支持空位比对和非空位比对；支持Illumina Genome Analyzer 、Sanger、454和SOliD的测序数据。
只要计算机有足够的内存，CLC Genomics Workbench可以将序列比对到任意大小的基因组上。在一台内存为16G的标准配置的计算机上，可以进行10倍于人类基因组数据的序列比对。
De novo assembly
CLC Genomics Workbench的De novo assembly功能支持short reads、long reads及paired reads；支持Illumina Genome Analyzer 、Sanger、454和SOliD的测序数据；可拼装任意大小的基因组。
Read mapping &De novo assembly同时支持不同类型数据的分析。例如，可在同一分析中对Sanger数据、454 single read数据和Illumina paired end数据进行从头拼装。使用该功能，用户无需进行枯燥的数据运算，显著减少了手工作业量。
下载仅供下载体验和测试学习，不得商用和正当使用。
